Quando um arquivo mestre é ordenado, o programa MSRT atualiza somente o .xrf, substituindo as entradas correspondentes de cada par de registros que estão sendo ordenados. No final deste processo, a menos que se use a opção -mfn, o arquivo .mst é atualizado, atribuindo os números de registro ao campo mfn do leader do registro. Esta atualização se realiza no mesmo lugar dos registros, o que significa que os registros são modificados em suas próprias localizações, portanto, a organização do arquivo mestre processado não muda. Desta maneira se poupa o tempo que se
gasta com a gravação no arquivo mestre de todos os registros ordenados.